根據(jù)上述職責，市對外貿易經(jīng)濟合作局（市口岸局）設10個內設機構：

（一）辦公室。

負責文電、會務、機要、檔案等機關日常工作；承擔保密、信訪、政務公開、辦公自動化、督辦等工作。負責局機關安全保衛(wèi)、行政、后勤管理、駐外辦事處和物業(yè)管理。審核境外非企業(yè)經(jīng)濟組織在本市設立常駐代表機構工作；參與全市性對外經(jīng)貿和口岸的重要外事活動；組織本局外事活動、重要來賓的接待工作和對外交流工作。

（二）政策法規(guī)綜合科。

承擔有關規(guī)范性文件的合法性審核；承辦有關行政復議和行政應訴工作；依法承擔對經(jīng)營者集中行為的調查及其他反壟斷相關工作；會同有關部門處理涉外知識產權和貿易糾紛；承擔協(xié)調牽頭整頓和規(guī)范外經(jīng)貿市場秩序的相關工作；承擔本局的法制宣傳教育工作；負責反傾銷、反補貼、保障措施和產業(yè)損害調查等涉及進出口公平貿易的相關工作；負責組織依法行政執(zhí)法檢查和執(zhí)法責任制檢查工作，推進依法行政和依法治貿工作；負責重要和綜合性文件的起草、政務信息的綜合上報、新聞報道、外經(jīng)貿信息網(wǎng)站建設職能。

（三）規(guī)劃財務科。

負責編報和組織實施外經(jīng)貿發(fā)展戰(zhàn)略、中長期發(fā)展規(guī)劃和外貿年度指導性計劃；會同有關部門貫徹落實涉及外經(jīng)貿的外匯、財稅、金融、價格、保險等政策，監(jiān)測、統(tǒng)計、分析對外貿易宏觀運行情況；會同有關部門管理專項資金；負責局機關財務管理、直屬單位財務檢查和內部審計工作。

（四）對外貿易發(fā)展科。

牽頭擬訂國際（境外）市場開拓規(guī)劃；推廣電子商務等新型貿易方式；承擔協(xié)調促進外向型民營企業(yè)發(fā)展的相關工作；推進出口市場多元化戰(zhàn)略的實施；指導和監(jiān)督境內對外經(jīng)貿交易會、展覽會以及赴國（境）外舉辦展銷會、洽談會等活動；協(xié)調指導對臺貿易工作；會同有關部門擬訂促進服務貿易進出口政策、規(guī)劃并組織實施；承擔服務貿易進出口管理、服務貿易促進和服務貿易統(tǒng)計工作；負責處理市貿促支會和國際商會的日常工作。

（五）對外貿易管理科（市機電產品進出口辦公室）。

組織實施進出口商品目錄；承擔進出口企業(yè)經(jīng)營資格及國際貨運代理資格備案工作；審核企業(yè)申請限制類商品進出口經(jīng)營資質；組織實施重要工業(yè)品、原材料和重要農產品（除糧食、棉花外）進出口計劃以及進出口商品配額、關稅配額計劃；審核有關進出口許可證事項；協(xié)調供應港澳的配額商品工作；審核機電產品自動進口工作；辦理授權的有關進出口許可事項；承擔推動機電產品開拓國際市場的相關工作；組織實施科技興貿戰(zhàn)略和國際品牌建設；協(xié)調促進高新技術和自主品牌企業(yè)開拓國際市場；組織落實優(yōu)化高新技術產品進出口結構等工作。負責對外經(jīng)濟合作工作，處理對外經(jīng)濟合作重大事件；指導和監(jiān)督對外承包工程、勞務合作以及境外投資工作。

（六）外資與加工貿易管理科。

參與制定本市外商投資的發(fā)展戰(zhàn)略、中長期規(guī)劃、年度指導計劃并組織實施；參與擬訂外商投資政策和管理規(guī)章；會同有關部門擬訂并組織實施服務外包發(fā)展規(guī)劃和政策；承辦限額以內不需綜合平衡管理的鼓勵類、允許類外商投資項目登記備案與合同、章程的合并辦理工作；依照有關規(guī)定核準或審核外商投資項目合同章程及法律特別規(guī)定的重大變更事項；核發(fā)外商投資企業(yè)、港澳臺投資企業(yè)批準證書及權限內鼓勵類外商投資項目確認證書；依法監(jiān)督檢查外商投資企業(yè)執(zhí)行法律法規(guī)和合同、章程的情況并協(xié)調解決有關問題；承擔外商投資統(tǒng)計工作；組織協(xié)調有關部門對外商投資企業(yè)進行聯(lián)合年檢；負責核準權限內的加工貿易業(yè)務；指導、管理外商投資企業(yè)與加工貿易企業(yè)的進出口工作；編報和組織實施外商投資企業(yè)和加工貿易企業(yè)涉及國家實行配額、許可證管理的進出口商品計劃；承擔加工貿易統(tǒng)計工作，協(xié)調解決外商投資企業(yè)投訴有關問題；會同有關部門督促檢查市直外商投資企業(yè)安全生產工作。

（七）外商投資促進科。

負責協(xié)調和指導本市對外招商引資、投資促進工作；參與制定本市促進外商投資規(guī)劃和改善投資環(huán)境的政策措施；編制對外招商計劃和招商目錄，建立完善招商項目庫；指導和協(xié)調引資和投資促進工作；擬訂本市對外招商引資計劃，組織實施重大項目對外招商；負責與境外投資促進機構聯(lián)系交流。

（八）口岸綜合科。

組織指導開展共建社會主義精神文明口岸活動。負責口岸物業(yè)管理和后勤保障；負責對口岸建設資金提出分配、使用意見；負責口岸計算機網(wǎng)絡管理和監(jiān)督工作；負責口岸業(yè)務數(shù)據(jù)、信息資料統(tǒng)計工作。

（九）陸空口岸科。

負責一、二類口岸的現(xiàn)場管理及倉儲管理；負責協(xié)調、處理口岸檢查檢驗單位之間的關系；負責擬訂一、二類口岸建設發(fā)展規(guī)劃并組織實施；負責組織陸空口岸查驗方法和監(jiān)管模式的改革。

（十）人事科（與系統(tǒng)黨委辦公室、監(jiān)察室合署）。

負責局機關及指導直屬單位的機構編制、干部人事管理和綜合治理工作；負責局機關人員的工資、醫(yī)療保險和計劃生育管理工作；承辦因公出國（境）護照、通行證等相關手續(xù)；負責局機關和指導直屬單位離退休人員管理。

負責局機關及直屬單位的紀檢、監(jiān)察工作；會同有關部門查處口岸重大涉外事件和嚴重違法違紀問題。負責局機關和外經(jīng)貿系統(tǒng)黨的組織、宣傳等黨建工作；協(xié)調系統(tǒng)工會、共青團、婦女工作。