中華人民共和國深圳海關(guān)前身為“九龍關(guān)”，1887年4月在香港成立。1949年10月，人民政府接管了九龍關(guān)并將其總部機構(gòu)由香港撤回深圳。1950年1月，根據(jù)海關(guān)總署的決定，“九龍關(guān)”更名為“中華人民共和國九龍海關(guān)”，保留“九龍”這個關(guān)名，其意義在于顯示中國人民維護國家主權(quán)和領(lǐng)土完整的決心。1997年7月1日，香港回歸祖國，本著“一國兩制”的原則，根據(jù)國務(wù)院的決定，“九龍海關(guān)”更名為“深圳海關(guān)”，江澤民總書記親筆題寫了“中華人民共和國深圳海關(guān)”的新關(guān)名。
　　深圳海關(guān)直屬中華人民共和國海關(guān)總署領(lǐng)導(dǎo)，并受廣東分署的監(jiān)督指導(dǎo)，總部位于深圳市，其業(yè)務(wù)管轄區(qū)域包括深圳市及惠州市。目前全關(guān)共有干部員工5800余人，設(shè)有48個處級以上機構(gòu)，其中內(nèi)設(shè)機構(gòu)21個，隸屬機構(gòu)18個，派駐機構(gòu)5個，其他機構(gòu)4個。海、陸、空監(jiān)管業(yè)務(wù)齊全。
　　深圳海關(guān)的職能是：依法對經(jīng)深圳口岸進出境的貨物、運輸工具、行李郵遞物品等進行監(jiān)管；征收關(guān)稅和其它法定由海關(guān)征收的稅費；查緝走私；開展貿(mào)易統(tǒng)計并辦理其他海關(guān)業(yè)務(wù)。
　　目前，深圳海關(guān)旅檢業(yè)務(wù)占全國55%，加工貿(mào)易監(jiān)管占全國1/5，快件監(jiān)管業(yè)務(wù)占全國1/3，稅收征管約占全國9%，運輸工具監(jiān)管約占全國70%。
　　深圳口岸是全國最繁忙的口岸之一，深圳海關(guān)也是全國任務(wù)最繁重的海關(guān)之一，深圳海關(guān)以自身特有的位置，在新中國經(jīng)濟和社會建設(shè)的各個時期都發(fā)揮了重要作用。改革開放以來，深圳海關(guān)主動適應(yīng)經(jīng)濟特區(qū)發(fā)展需要，深化業(yè)務(wù)改革，加強隊伍建設(shè)，不斷完善和改進自身工作，促進地方經(jīng)濟發(fā)展。